古より、歴史の裏で続いてきた人類と堕天使“虚骸（ニヒル）”との闘い。家族を失ったレヴィは、発明王にして大魔術師のエジソンに弟子入りし、虚骸と闘う魔装機師（アルチザン）になることを決意する。それから５年――。16歳になったレヴィは、英国にある退魔機関トリスアギオンに所属し、倫敦（ロンドン）を震わす怪人、スウィーニー・トッド事件を追うことになるが――!?